Essa organela é responsável, principalmente, pela síntese de proteínas. Por isso, trabalha em conjunto com o Complexo de Golgi, e está presente em grande quantidade em células com função excretora, como as do intestino e do pâncreas.
O R.E. Rugoso sintetiza as proteínas e depois as transporta, por meio de vesículas de transferência, para o Complexo de Golgi, que irá modificá-las, empacotá-las e secretá-las para o meio extracelular, por meio da exocitose, ou formará vesículas, chamadas lisossomos, que participaram da digestão intracelular.
Além de estar presente em grande quantidade em células com função excretora, o R.E. Rugoso também tem um outro papel fundamental: junto ao Complexo de Golgi, participa da formação do acrossomo do espermatozóide, o qual contém enzimas importantes que degradam a membrana dos óvulos para a fecundação.
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